妖精ナビィがリンクに告げる。ゾーラ川から冷気が漂ってくるようだと。急ぎ、ゾーラ川をさかのぼっていくと、そこに待っていたのはゾーラ族の王キングゾーラであった。キングゾーラは娘である「ルト姫」の安否とゾーラの守り神である「ジャブジャブ様」の異変を気にかけていた。
水中深く潜れるという「銀のウロコ」を手に入れたリンクはハイリア湖へ行き、ルト姫の手紙を発見する。手紙には「中でまっておる」と書かれていた。ルト姫の行方とジャブジャブ様の異変には何か関係があるのか？
リンクはジャブジャブ様がいるというゾーラの泉へと向かうのであった。