スカイランダーたちは武器や魔法を使ってスカイランドを守り続けてきた。しかし突如現れた悪者によって、彼らは地球へ吹き飛ばされ、おもちゃになってしまった。

スターターパックについている「パワーポータル」にフィギュアをのせると、ゲームの中にスカイランダーを呼び出せる。呼び出したスカイランダーを操作してゲームを進めていく。ポータルにのせているキャラクターはリアルタイムでゲームの中に現れる。

スカイランダーがゲーム内で得た経験値やアイテムなどは、それぞれのフィギュアに直接記録される。これによりプレイヤーは、フィギュアを自分だけのスカイランダーとして育てることができる。

スカイランダーは独自のパワーと性格を持っている。特定の属性のスカイランダーしか入ることができない場所に行き着いたり、操作しているスカイランダーの体力がなくなった場合は、いつでもスカイランダーを交代することができる。

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