Wii本体の電源を入れたら、Wiiメニュー画面で『聖剣伝説2』のチャンネルを選んでください。

タイトル画面でいずれかのボタンを押すと、タイトルメニューが表示されます。上下でメニューを選び、で決定してください。 なお、初めて遊ぶときは「ニューゲーム」のみ選べます。

「ニューゲーム」を選ぶと主人公（ランディ）の名前を決めて、最初からゲームを始めることができます。で文字を選び、で決定してください。またはを押すと1文字削除できます。入力ができたらを押しましょう。

「ゲームファイル」を選ぶとセーブデータを選んで、前回の続きからゲームを再開することができます。

主人公たちを操作してフィールドを冒険し、敵と戦ったり、情報収集をして、ストーリーを進めていきましょう。

キャラクターは敵を倒すと経験値（EXP）を手に入れます。一定の経験値がたまるとキャラクターがレベルアップして、HPやちから、すばやさなどの能力が高くなります。 また、このほかに武器ごとに「武器レベル」、魔法をつかさどる精霊ごとに「魔法レベル」があり、それぞれ武器と魔法を使うことで上がっていきます。

キャラクターにはそれぞれHPがあり、ダメージを受けると減っていきます。HPが0になると戦闘不能になってしまうので注意してください。味方全員が戦闘不能になってしまうとゲームオーバーになり、タイトル画面に戻ります。