繰り広げられる、さまざまな任務（ミッション）バミューダ宙域の主要な惑星エクセルシオン、バイオン、タルバニアを舞台に繰り広げられるスペースパイレーツとの戦い。銀河連邦軍隊員の1人として、遺跡の探索や重要施設の防衛など司令官から与えられるさまざまな任務を遂行せよ。

EXCELCION 極寒の地「エクセルシオン」バミューダ系の第一惑星。天然資源が豊富で、銀河連邦はかつて採掘活動も行っていた。しかし、約20年前の巨大隕石の衝突によって極寒の地となってしまっている。この星には放棄された銀河連邦の基地もあり、再建を試みている。
Mission01 極寒の地で挑む初任務。新型メックの力を見せつけろ。原始生物排除 連邦軍の基地跡から原始生物をすべて排除せよ。
Mission04 凶暴な巨大生物との遭遇。アイスビーストの捕獲へ向かえ。ビースト捕獲 連邦生物研究所の周辺を徘徊するアイスビーストを捕獲せよ。
Mission07 消息を絶った調査隊に何が起こったのか！？地底湖から仲間を助け出せ。調査隊捜索 消息の途絶えた調査隊を捜索せよ。
Mission19 明らかになったパイレーツの狙い。敵の重要施設を破壊せよ。強行突破 パイレーツに占拠された施設へ突入せよ。
BION 高温の灼熱地帯「バイオン」バミューダ系の第二惑星。高熱の灼熱地帯だ。かつて高度な古代文明が栄えていたことで知られている。この星の古代種族はオーブと呼ばれる球体を崇める独自の信仰を持っていた。だが、はるか昔に絶滅してしまっている。
Mission02 古代神殿から発せられる謎の信号。灼熱の大地に隠された謎を解き明かせ。神殿探索 謎の信号の発生源を特定せよ。
Mission05 絶滅した古代種族が残したものとは！？データ回収のため、古代遺跡に向かえ。遺跡調査 古代遺跡に眠るデータコーデックスを回収せよ。
Mission09 立ちふさがる、雷撃の脅威。貴重なエネルギー源を回収せよ。カート護送 パワーセルを積んだカートをカーゴシップまで運搬せよ。
Mission12 背水の陣で臨む戦い。地下遺跡の探査機を死守せよ。防衛戦線 迫りくる巨大生物から地下探査機を防衛せよ。
TALVANIA 高度な文明を誇った「タルバニア」バミューダ系の第三惑星。かつて高度な機械文明を持った種族が住んでいた。しかし数百年前、彼らはこの星を棄てて他の星へ移住したと考えられている。そのため、今は誰も住んでいない。
Mission03 滅びた機械文明の地に発生する電磁波の正体とは？ 電磁波の停止へ向かえ。電磁波停止 発電所付近から発生している電磁波を停止せよ。
Mission06 敵の弾道ミサイル製造を阻止せよ。危険な潜入破壊工作に挑め。潜入指令 パイレーツのミサイル製造工場へ潜入し、これを破壊せよ。
Mission10 狙われた母艦イージス。敵のミサイル輸送船を迎撃せよ。母艦防衛 弾道ミサイルの発射を阻止せよ。
Mission13 パイレーツの企みを暴くため、奴らの機密データを奪取せよ。秘密技術奪取 パイレーツのテクノロジーが保存されているデータユニットを奪取せよ。