道中ステージをクリアしてエリアマップに道を作り、城ステージをクリアして次のエリアに進みましょう。なお、エリアマップ画面や各ステージ画面でを押すと、ポーズ（一時中断）ができます。

ゴエモンたちを操作して敵を倒しながら進み、制限時間内にステージの最後にある狸の置物を壊しましょう。敵を倒すと、買い物などに使う小判や、武器がパワーアップする「招き猫」が出現することがあり、触れると取ることができます。 アイテムの紹介

町ステージの「よろず屋」で買ったアイテムが表示されます。「よろず屋」で買ったアイテムはダメージを受けたときや、ライフがなくなったときなどに自動で使用されます。 また、ポーズ中は表示されるアイテムが変わります。

道中ステージまたは城ステージにある「これ象くん」を取ると、ミスした場合に「これ象くん」を取った場所から再開できます。ただし、一度そのステージをクリアすると効果はなくなります。

各エリアに1つだけあるステージで、そのエリアを支配するボスが待ちかまえています。画面の見かたや基本的なルールは道中ステージと同じですが、さまざまな仕掛けが行く手を阻みます。制限時間内にボスを倒し、クリアしてください。なお、ボスを倒したあとに「高速ステージ」→「3Dボス対戦ステージ」に進む場合もあります。