ステージ選択画面で挑戦するステージを選び、アクション画面でステージクリア（ボスの撃破）を目指します。8つのステージは自由な順番で挑戦でき、すべてクリアすると、シグマのステージに進めるようになります。

ボスの絵が描かれた8つのステージと、「STAGE」「MAP」「SPEC」「ROCKMAN X」の4つのボタンが表示されます。 ステージを開始するには、ボスの絵を選択してまたはを押してください。 4つのボタンのうちいずれかを押してからボスの絵を選ぶと、そのステージの詳細情報を確認できます。

ロックマンXを操作して、ステージの最後で待ち構えているボスを倒します。また、を押すと、武器選択画面を表示できます。

ボスとの戦いでは、ボスのライフエネルギーを示す「ボスエネルギーゲージ」が表示されます。

武器を選択したり、エスケープ・ユニットやサブタンクを使ったりできます。を押すと、アクション画面に戻ります。 アイテム紹介

ロックマンXの残り人数が0のときに、ステージ中でライフエネルギーが0になると、パスワード画面が表示されます。パスワード画面が表示された際に／／／／のいずれかのボタンを押すと、コンティニューができます。なお、コンティニュー回数に制限はありません。